黃河流域生態環境監督管理局為生態環境部正局級派出行政機構，在所轄黃河入海斷面以上流域和西北諸河，依據法律、行政法規的規定和生態環境部的授權或委托，負責水資源、水生態、水環境方面的生態環境監管工作。主要承擔以下職責：一、負責編制流域生態環境規劃、水功能區劃，參與編制生態保護補償方案，并監督實施；二、提出流域水功能區納污能力和限制排污總量方案建議；三、建立有跨省影響的重大規劃、標準、環評文件審批、排污許可證核發會商機制，并組織監督管理；四、參與流域涉水規劃環評文件和重大建設項目環評文件審查，承擔規劃環評、重大建設項目環評事中事后監管；五、指導流域內入河排污口設置，承辦授權范圍內入河排污口設置的審批和監督管理；六、指導協調流域飲用水水源地生態環境保護、水生態保護、地下水污染防治有關工作；七、組織開展河湖與岸線開發的生態環境監管、河湖生態流量水量監管，參與指導協調河湖長制實施、河湖水生態保護與修復；八、組織協調南水北調等重大工程項目區水質保障；九、組織開展流域生態環境監測、科學研究、信息化建設、信息發布等工作；十、組織擬訂流域生態環境政策、法律、法規、標準、技術規范和突發生態環境事件應急預案等；十一、承擔流域生態環境執法、重要生態環境案件調查、重大水污染糾紛調處、重特大突發水污染事件應急處置的指導協調等工作；十二、指導協調監督流域內生態環境保護工作，協助開展流域內中央生態環境保護督察工作；十三、承擔生態環境部交辦的其他工作。